Nella successiva epoca giustinianea, in cui la chiesa fu riconsacrata al culto ortodosso, molti mosaici vennero epurati in quanto direttamente collegati all’eresia ariana: due teorie di dignitari goti vennero sostituite con importanti cortei di vergini e di martiri, espressione dello splendore e della ricchezza del mosaico bizantino, testimoni del trionfo della politica imperiale e della nuova fede ripristinata.
L’importanza che questo edificio ha continuato a rivestire nel corso dei secoli è ribadita dalle significative opere di aggiornamento a cui fu soggetto intorno al Mille, quando vennero aggiunti la cripta e il campanile cilindrico.
Ulteriori restauri furono effettuati dal XVI al XX secolo. Nel XVI secolo furono apportate modifiche sostanziali sia a livello architettonico che decorativo. Dal XIX al XX secolo, cambiando il concetto di restauro e di tutela, gi interventi sono stati dettati solo da motivi di salvaguardia e conservazione.
Obiettivo del lavoro è quindi quello di ricostruire, tramite la documentazione disponibile, la «lunga vita» di uno dei monumenti più significativi dell’arte bizantina.